São desenvolvidos programas de pesquisa e adotadas medidas de monitoramento e controle sobre ocorrência de pragas, doenças e incêndios florestais. A proteção florestal visa também o estudo da fauna local e suas interações com os plantios de eucalipto de modo a utilizar essas populações como aliadas na manutenção da estabilidade biológica dos povoamentos.

Uma vasta investigação tem sido realizada para compreender o efeito do manejo sobre as características da madeira e a constituição intrínseca do material genético para prover melhoramento, focado no atendimento das necessidades dos clientes internos e externos.

Novas tecnologias são utilizadas como a genômica, modelagem das propriedades da madeira e espectroscopia de infravermelho próximo como ferramentas de análise e predição. Dessa forma é possível recomendar melhores materiais tanto para a formação dos plantios comerciais quanto para a identificação de linhas de trabalho em melhoramento genético e manejo florestal.